108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3088 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  100 
 
 		 126 aa  251  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  50 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  38.6 
 
 		 114 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  38.05 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  38.61 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  36.73 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  36.08 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  38.1 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  36.79 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  37 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  38.14 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  33.72 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  36.61 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  40.62 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2076  anti-anti-sigma factor family protein  37.25 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  35.78 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2606  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  36 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  36.26 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  30.56 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  38.64 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  39.29 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  36.19 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  39.58 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  38 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  39 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  50.98 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.36 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  27.71 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  35.64 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  30.77 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.7 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5807  anti-sigma-factor antagonist  35.64 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.78678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2021  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  42.42 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  34.04 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2088  putative PAS/PAC sensor protein  36.84 
 
 		 340 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00176198  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.18 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.25 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  30 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  40.62 
 
 		 846 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  34.65 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  29.21 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  33.73 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.63 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0968  anti-sigma-factor antagonist  30.4 
 
 		 120 aa  44.3  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7890  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.737942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  43.9  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  36.96 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  25.81 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  32.56 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  32.86 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  29.66 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  35.48 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01250  anti-anti-sigma factor  33.03 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  35.79 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3448  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0429116  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1029  anti-sigma-factor antagonist  37.8 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  32.56 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  26.47 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  23.42 
 
 		 111 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  26.96 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 136 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  39.39 
 
 		 117 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3633  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 		 120 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.786299  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 115 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  24.75 
 
 		 104 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  22.12 
 
 		 109 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  24.75 
 
 		 104 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 106 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  28.32 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4150  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3237  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>