122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12900 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  100 
 
 		 114 aa  224  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26340  anti-anti-sigma factor  46.9 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  47.27 
 
 		 138 aa  97.4  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  41.59 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  40.78 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  43.88 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  40.57 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  41.46 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.39 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  34.31 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  41.38 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  38.24 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3879  anti-sigma-factor antagonist  36.17 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3946  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1819  anti-sigma-factor antagonist  39.13 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0899  anti-sigma-factor antagonist  40.3 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0916  anti-sigma-factor antagonist  40.3 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0905  anti-sigma-factor antagonist  40.3 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0599283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2021  anti-sigma-factor antagonist  35.78 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  38.04 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  39.78 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  31.63 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  36.7 
 
 		 118 aa  52  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3237  anti-sigma-factor antagonist  39.81 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  34.02 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  28.85 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  35.19 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  28.16 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  28.16 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  28.72 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  33.33 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  30.65 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2530  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  28.95 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0359  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0369  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0348  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11180  anti-anti-sigma factor  36.73 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0792336 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4293  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  31.48 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188553  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  26.85 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2898  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2942  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2928  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402963  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  24.3 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  25.49 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2843  anti-sigma-factor antagonist  36.26 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000855311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2744  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146938  normal  0.0434757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  31.19 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2758  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  21.9 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  30.19 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5185  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5274  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4702  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.886766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  30.09 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11933  hypothetical protein  27.45 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  21.7 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  26.85 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4424  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.627272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  30.97 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0968  anti-sigma-factor antagonist  33.63 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226616  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0702  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44246  normal  0.0163472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  27.68 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2630  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.692225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15781  STAS domain-containing protein  33.75 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2023  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.861552  normal  0.437325 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1153  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.63 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  38.82 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  29.76 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  30.28 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1311  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  25.69 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  35.48 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  27.52 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5292  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.11598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 114 aa  42.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>