27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0369 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0359  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 151 aa  308  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280316  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0348  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 151 aa  308  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0369  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 151 aa  308  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0395  anti-sigma-factor antagonist  54.41 
 
 		 135 aa  155  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.062058  normal  0.536153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0343  anti-sigma-factor antagonist  54.41 
 
 		 135 aa  146  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10527  hypothetical protein  38.57 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2530  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1311  anti-sigma-factor antagonist  39.36 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3879  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1299  anti-sigma-factor antagonist  38.3 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0217116  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1282  anti-sigma-factor antagonist  38.3 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4788  anti-sigma-factor antagonist  30.97 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0365587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0203  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0702  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44246  normal  0.0163472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1661  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.744835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2942  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2898  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2928  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402963  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0899  anti-sigma-factor antagonist  35.62 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0905  anti-sigma-factor antagonist  35.62 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0599283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0916  anti-sigma-factor antagonist  35.62 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2023  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.861552  normal  0.437325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  27.37 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4700  anti-sigma-factor antagonist  39.73 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  35.38 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3140  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 143 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.035847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>