35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4700 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4700  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 135 aa  271  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2023  anti-sigma-factor antagonist  76.3 
 
 		 135 aa  207  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.861552  normal  0.437325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5536  hypothetical protein  43.57 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0792595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2530  anti-sigma-factor antagonist  41.58 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3879  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0203  anti-sigma-factor antagonist  37.08 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1311  anti-sigma-factor antagonist  43.37 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1299  anti-sigma-factor antagonist  43.37 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0217116  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1282  anti-sigma-factor antagonist  43.37 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4788  anti-sigma-factor antagonist  37.97 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0365587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0702  anti-sigma-factor antagonist  40.96 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44246  normal  0.0163472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2928  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402963  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2898  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2942  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1661  anti-sigma-factor antagonist  36.47 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.744835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0905  anti-sigma-factor antagonist  37.35 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0599283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0899  anti-sigma-factor antagonist  37.35 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0916  anti-sigma-factor antagonist  37.35 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10527  hypothetical protein  36.99 
 
 		 158 aa  52  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  41.18 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5244  hypothetical protein  38.04 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5155  hypothetical protein  38.04 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0348  anti-sigma-factor antagonist  39.73 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0359  anti-sigma-factor antagonist  39.73 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0369  anti-sigma-factor antagonist  39.73 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  32.41 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5095  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2758  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6544  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 		 108 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226563  normal  0.0671959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2744  anti-sigma-factor antagonist  37.18 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146938  normal  0.0434757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  37.21 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0395  anti-sigma-factor antagonist  34.25 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.062058  normal  0.536153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3674  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.629343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  37.31 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>