35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3879 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3879  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2530  anti-sigma-factor antagonist  67.76 
 
 
155 aa  217  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2928  anti-sigma-factor antagonist  53.38 
 
 
148 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402963  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2898  anti-sigma-factor antagonist  53.38 
 
 
148 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2942  anti-sigma-factor antagonist  53.38 
 
 
148 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0203  anti-sigma-factor antagonist  41.53 
 
 
152 aa  104  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359071  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0702  anti-sigma-factor antagonist  44 
 
 
152 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44246  normal  0.0163472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1661  anti-sigma-factor antagonist  38.17 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.744835  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4788  anti-sigma-factor antagonist  37.4 
 
 
144 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0365587  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0916  anti-sigma-factor antagonist  46.39 
 
 
106 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239585  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0899  anti-sigma-factor antagonist  46.39 
 
 
106 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0905  anti-sigma-factor antagonist  46.39 
 
 
106 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0599283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1282  anti-sigma-factor antagonist  38.79 
 
 
141 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1311  anti-sigma-factor antagonist  38.79 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1299  anti-sigma-factor antagonist  38.79 
 
 
141 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0217116  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2023  anti-sigma-factor antagonist  46.59 
 
 
135 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.861552  normal  0.437325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4700  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572839  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5536  hypothetical protein  38.3 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0792595  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0348  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0359  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0369  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10527  hypothetical protein  34.21 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  36.17 
 
 
114 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0343  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0395  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 
135 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.062058  normal  0.536153 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0260  anti-anti-sigma regulatory factor  30.93 
 
 
99 aa  51.2  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15781  STAS domain-containing protein  34.78 
 
 
118 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  32.98 
 
 
134 aa  50.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09291  STAS domain-containing protein  30.93 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0243906 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1153  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.52 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406028  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26340  anti-anti-sigma factor  35.48 
 
 
142 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11933  hypothetical protein  30.56 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  34.65 
 
 
127 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1306  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.17 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  36.23 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>