42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11933 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11933  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  286  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12656  hypothetical protein  52.38 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000514041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11396  anti-anti-sigma factor rsfA  47.73 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.971346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11180  anti-anti-sigma factor  35.9 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0792336 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26340  anti-anti-sigma factor  31.58 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2088  putative PAS/PAC sensor protein  33.64 
 
 		 340 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00176198  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3946  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2530  anti-sigma-factor antagonist  34.26 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0203  anti-sigma-factor antagonist  25.56 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1311  anti-sigma-factor antagonist  28.33 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1299  anti-sigma-factor antagonist  27.5 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0217116  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1282  anti-sigma-factor antagonist  27.5 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  26.96 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5274  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5185  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  27.45 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3879  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  24.35 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  26.55 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  26.5 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1306  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.57 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.43 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  33.03 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  27.93 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  25.25 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 138 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0701  anti-sigma-factor antagonist  22.41 
 
 		 116 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  27.03 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  27.08 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  37.93 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  27.84 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  33.85 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  23.68 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  30.84 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  27.1 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5566  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 114 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>