132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11180 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11180  anti-anti-sigma factor  100 
 
 		 151 aa  294  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0792336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  45.97 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  43.12 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11933  hypothetical protein  35.9 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  55 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11396  anti-anti-sigma factor rsfA  32.69 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.971346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  44.66 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  38.53 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  36.73 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12656  hypothetical protein  36.67 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000514041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  34.68 
 
 		 130 aa  62  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  36.73 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3164  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.833812  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  40.59 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  37.25 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3946  anti-sigma-factor antagonist  37.25 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5185  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5274  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2606  anti-sigma-factor antagonist  39.81 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5566  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26340  anti-anti-sigma factor  33.01 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  34.71 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  35.45 
 
 		 116 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3237  anti-sigma-factor antagonist  37.17 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  32.43 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  38.38 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2744  anti-sigma-factor antagonist  42.03 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146938  normal  0.0434757 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2758  anti-sigma-factor antagonist  42.03 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4424  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.627272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  32.43 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.5 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  36.61 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  32.43 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  33.33 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3284  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.156911  normal  0.806624 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  34.51 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2021  anti-sigma-factor antagonist  35.24 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0122  anti-sigma-factor antagonist  38.64 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0701  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0557  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  24.75 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  34.31 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  31.53 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3434  anti-sigma-factor antagonist  36.79 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4293  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  39.24 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.95 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  34.41 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4702  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.886766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  32.73 
 
 		 111 aa  47.4  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  35.92 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 115 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4483  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 115 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 115 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5095  anti-sigma-factor antagonist  28.68 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6544  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226563  normal  0.0671959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  33.04 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  29.13 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2088  putative PAS/PAC sensor protein  30.61 
 
 		 340 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00176198  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0203  anti-sigma-factor antagonist  37.88 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  34.86 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  24.27 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  32.74 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2630  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.692225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  24.74 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  26.47 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0968  anti-sigma-factor antagonist  38.38 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226616  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  35.82 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2799  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 107 aa  43.9  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0294  anti-sigma factor antagonist  31.31 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  33.01 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3674  anti-sigma-factor antagonist  35.56 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.629343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2843  anti-sigma-factor antagonist  37.93 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000855311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  29.51 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0359  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0369  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 250 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2862  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  33.66 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>