81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2630 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2630  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 107 aa  213  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.692225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6632  anti-sigma-factor antagonist  91.59 
 
 		 107 aa  191  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2799  anti-sigma-factor antagonist  83.18 
 
 		 107 aa  175  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6544  anti-sigma-factor antagonist  67.29 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226563  normal  0.0671959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  45.36 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  43 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  42.27 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4848  anti-sigma-factor antagonist  42.57 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  42.16 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  41.75 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5292  anti-sigma-factor antagonist  44.66 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.11598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4116  anti-sigma-factor antagonist  40.95 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  35.79 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  30.19 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  40.21 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  34.23 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.69 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  30.1 
 
 		 112 aa  52.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  30.48 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  35.42 
 
 		 150 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  33.33 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  39.02 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  31.73 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2843  anti-sigma-factor antagonist  36.11 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000855311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  30 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3994  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  42.62 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121184  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  36.79 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7890  anti-sigma-factor antagonist  35.64 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.737942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  27.36 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.88 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  24.51 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0333  anti-sigma factor antagonist  30.69 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  32.11 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 		 250 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  36.56 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  35.87 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.26 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  33.96 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3679  hypothetical protein  31.96 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  28.26 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  25.69 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 1711 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 121 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  33.02 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  34.18 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  30.38 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32030  anti-anti-sigma factor  36.05 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320357  normal  0.297134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5095  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2243  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>