66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4116 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4116  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 111 aa  220  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  45.63 
 
 		 111 aa  87  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  43.14 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  47.13 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  41.35 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  36.11 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4848  anti-sigma-factor antagonist  43.88 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6544  anti-sigma-factor antagonist  40.95 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226563  normal  0.0671959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5292  anti-sigma-factor antagonist  45.87 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.11598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2799  anti-sigma-factor antagonist  41.9 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2630  anti-sigma-factor antagonist  40.95 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.692225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6632  anti-sigma-factor antagonist  41.58 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2843  anti-sigma-factor antagonist  36.89 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000855311  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  40.45 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  34.83 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.35 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 		 249 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  39.51 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  39.51 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  27.55 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  36.59 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  38.27 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  27.96 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2907  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.33 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4483  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2518  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  37.29 
 
 		 350 aa  44.7  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  29.7 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3994  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  33.71 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.121184  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  35.82 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3493  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.892416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  40.68 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  34.94 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  36.84 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  36.99 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  29.36 
 
 		 121 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  38.2 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.9 
 
 		 129 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2069  anti-sigma-factor antagonist and glycosyl transferase  34.78 
 
 		 505 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 122 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  24.18 
 
 		 104 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1569  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  33.33 
 
 		 332 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1592  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  33.33 
 
 		 332 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.928127  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  25.81 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15210  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  31.07 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  20.2 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  30.21 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>