78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4848 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4848  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 118 aa  233  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5292  anti-sigma-factor antagonist  69.3 
 
 		 115 aa  140  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.11598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  65.09 
 
 		 115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  66.33 
 
 		 115 aa  127  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  49.09 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  46.46 
 
 		 114 aa  90.9  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  52.27 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4116  anti-sigma-factor antagonist  43.88 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2799  anti-sigma-factor antagonist  41.58 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2630  anti-sigma-factor antagonist  42.57 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.692225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6632  anti-sigma-factor antagonist  41.58 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  32.04 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6544  anti-sigma-factor antagonist  35.64 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226563  normal  0.0671959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4483  anti-sigma-factor antagonist  37.62 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.18 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  29.13 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  29.06 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  28.18 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  35.51 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  37.08 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  27.72 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  30.28 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2769  anti-sigma-factor antagonist  38.75 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.000540965 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  33.01 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  27.96 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1364  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.941434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  35.94 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  24.32 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  38.3 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2572  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  40.3 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.149516 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  23.81 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4150  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  34.25 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  35.87 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  28.87 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  32.43 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  31.19 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  28.09 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  28.74 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  32.95 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  29.89 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2907  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.4 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0333  anti-sigma factor antagonist  30 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3069  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401391 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  24.27 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3434  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  23.71 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  27.59 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1255  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  38.04 
 
 		 112 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  20.41 
 
 		 104 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13130  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  30.86 
 
 		 114 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.25 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  36.51 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  26.74 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  31.51 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  27.59 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.13 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  24.73 
 
 		 145 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 117 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>