109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4532 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 114 aa  236  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  64 
 
 		 111 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  48.21 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  47.96 
 
 		 115 aa  103  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5292  anti-sigma-factor antagonist  51.52 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.11598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4848  anti-sigma-factor antagonist  46.46 
 
 		 118 aa  90.9  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  40.91 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4116  anti-sigma-factor antagonist  36.11 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6544  anti-sigma-factor antagonist  43.43 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.226563  normal  0.0671959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6632  anti-sigma-factor antagonist  40.78 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0661941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2630  anti-sigma-factor antagonist  41.75 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.692225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2799  anti-sigma-factor antagonist  40.95 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  37.37 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  32 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  36.61 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  35.24 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0085  anti-sigma-factor antagonist  31.13 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  33.04 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  29.2 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  30.23 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  30.69 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15210  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  33.72 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0632  anti-anti-sigma factor  28.89 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  36.73 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32030  anti-anti-sigma factor  34.78 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320357  normal  0.297134 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0391  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.46 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.250158  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.27 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2050  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  28.42 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01250  anti-anti-sigma factor  28.42 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  34.74 
 
 		 112 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3077  SpoIIAA family protein  32.53 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1719  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.85 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.131448  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  35.56 
 
 		 170 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  28.24 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  26.26 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  26.26 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0298  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.12 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  26.97 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3391  anti-anti-sigma factor  36.63 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.766696 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  26.26 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5145  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117847  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  34.69 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  34.57 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  26.17 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  26.19 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2843  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000855311  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3493  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.892416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 113 aa  43.5  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3434  anti-sigma-factor antagonist  30.48 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  29.47 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  31.94 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  17.35 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  33.01 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  25.26 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2243  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132935  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0471  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00988083  hitchhiker  0.0000661434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3633  anti-sigma-factor antagonist  37.8 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.786299  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  23.64 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2087  putative PAS/PAC sensor protein  37.08 
 
 		 666 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000976195  normal  0.0252685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  33.72 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0122  anti-sigma-factor antagonist  28.75 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2907  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.34 
 
 		 111 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  26.67 
 
 		 101 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22630  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 98 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3637  anti-sigma-factor antagonist  29.27 
 
 		 115 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 103 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  31.33 
 
 		 116 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  31.19 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  31 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  26.44 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2069  anti-sigma-factor antagonist and glycosyl transferase  34.29 
 
 		 505 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0557  anti-sigma-factor antagonist  31.13 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188337 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  27 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>