52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3637 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3637  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
115 aa  224  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3139  anti-sigma-factor antagonist  64.76 
 
 
140 aa  132  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.287339  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35180  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  57.26 
 
 
124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2965  anti-sigma-factor antagonist  63.55 
 
 
121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.496883  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2417  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 
111 aa  103  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  34.15 
 
 
122 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32030  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320357  normal  0.297134 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  36.9 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4123  anti-sigma-factor antagonist  34.26 
 
 
136 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 
111 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  35.71 
 
 
121 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
145 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0208  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 
117 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  31.71 
 
 
123 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  34.41 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 
100 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  36.17 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3493  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.892416  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  26.92 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5017  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  22 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7890  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.737942  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  33.33 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  28.24 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  22 
 
 
111 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 
120 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  22 
 
 
111 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  22 
 
 
111 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 
113 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  29.41 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  22 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  22 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  29.82 
 
 
115 aa  41.2  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  22 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  26.09 
 
 
117 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.18 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  26.37 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  37.18 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  22 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  30.16 
 
 
351 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0085  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 
115 aa  40  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  21 
 
 
112 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>