21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4123 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4123  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 136 aa  268  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2967  anti-sigma-factor antagonist  55.88 
 
 		 139 aa  110  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35230  STAS domain-containing protein  55.34 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3141  anti-sigma-factor antagonist  48.08 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.129085  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3639  anti-sigma-factor antagonist  46.09 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15210  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  35.11 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2419  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3203  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0122  anti-sigma-factor antagonist  38.38 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  32.41 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.31 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3637  anti-sigma-factor antagonist  36.84 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388001 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3863  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 		 286 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.873271  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2050  anti-sigma-factor antagonist  35.85 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3140  anti-sigma-factor antagonist  44.93 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.035847  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  39.77 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01250  anti-anti-sigma factor  45.28 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  38.78 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3448  anti-sigma-factor antagonist  34.92 
 
 		 112 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0429116  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  35.19 
 
 		 166 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>