42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3203 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3203  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 109 aa  203  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35230  STAS domain-containing protein  42.55 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3639  anti-sigma-factor antagonist  37.89 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4364  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3141  anti-sigma-factor antagonist  36.14 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.129085  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1503  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.696241  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4123  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2820  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2967  anti-sigma-factor antagonist  38.55 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3689  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34370  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  28.74 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1992  anti-sigma-factor antagonist  28.09 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2225  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.999685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  31.03 
 
 		 101 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1541  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  30.34 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  31.03 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2180  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.52 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2419  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32030  anti-anti-sigma factor  35.63 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320357  normal  0.297134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01250  anti-anti-sigma factor  31.58 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0122  anti-sigma-factor antagonist  35.64 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  27.59 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  38.1 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  35.11 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  34.04 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  34.04 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 101 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3579  anti-sigma-factor antagonist  39.29 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  31.68 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0945  anti-anti-sigma regulatory factor  26.53 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959965  hitchhiker  0.00175597 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  32 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  32 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  32 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  33.68 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  29.52 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0946  anti-sigma F factor antagonist, putative  41.07 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  27.27 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4150  anti-sigma-factor antagonist  35.85 
 
 		 122 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>