15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3141 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3141  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 128 aa  248  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.129085  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2967  anti-sigma-factor antagonist  66.99 
 
 		 139 aa  146  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35230  STAS domain-containing protein  55.24 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4123  anti-sigma-factor antagonist  48.08 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3639  anti-sigma-factor antagonist  48.04 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2419  anti-sigma-factor antagonist  34.58 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3203  anti-sigma-factor antagonist  36.14 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0122  anti-sigma-factor antagonist  47.27 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4483  anti-anti-sigma regulatory factor  34.48 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000247107  normal  0.911013 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.63 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2050  anti-sigma-factor antagonist  38.37 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0085  anti-sigma-factor antagonist  42.31 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0388  anti-sigma-factor antagonist  31.67 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  24.49 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0298  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224332  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>