84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1992 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1992  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 107 aa  219  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2820  anti-sigma-factor antagonist  65 
 
 		 101 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  63 
 
 		 101 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  63 
 
 		 101 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34370  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  63 
 
 		 101 aa  130  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  63 
 
 		 101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4364  anti-sigma-factor antagonist  62 
 
 		 101 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1503  anti-sigma-factor antagonist  62 
 
 		 101 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.696241  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3689  anti-sigma-factor antagonist  60 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3452  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  59 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.466044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1541  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  56 
 
 		 99 aa  120  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875009  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1963  STAS domain protein  58 
 
 		 100 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.259711  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  55 
 
 		 101 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2180  flagellar basal-body rod protein FlgB  55.88 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2416  anti-sigma-factor antagonist  43 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015086 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3441  anti-sigma-factor antagonist  51.61 
 
 		 100 aa  91.3  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3579  anti-sigma-factor antagonist  48.31 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1038  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  43.56 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0733  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  46.59 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01716  putative anti-sigma factor antagonist  41.58 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2957  anti-sigma-factor antagonist  43.75 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3533  hypothetical protein  40.4 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3117  anti-anti-sigma regulatory factor  39.77 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1593  anti-sigma-factor antagonist  39 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3296  anti-sigma-factor antagonist  41.77 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2225  anti-sigma-factor antagonist  37.62 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.999685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3069  hypothetical protein  39.6 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401391 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2118  SpoIIAA family protein  38.64 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0411  hypothetical protein  39.08 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.368048  normal  0.907384 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1390  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.96 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2095  SpoIIAA family protein  35.23 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2367  SpoIIAA family protein  35.23 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00979283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2250  SpoIIAA family protein  35.23 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0929846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0945  anti-anti-sigma regulatory factor  33.33 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959965  hitchhiker  0.00175597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2107  SpoIIAA family protein  36.36 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0440  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0996499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2221  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1878  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838395  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2096  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0156  putative anti-sigma F factor antagonist  37.62 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3203  anti-sigma-factor antagonist  28.09 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0946  anti-sigma F factor antagonist, putative  42.11 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0278  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.9 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0196  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1771  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  31.03 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  22.55 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.37 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  27.18 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4483  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  26.88 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  28.26 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2094  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000638227  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  23.91 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4774  anti-sigma-factor antagonist  39.06 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 846 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  25.29 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  21.43 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  26.26 
 
 		 250 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  25.61 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  23.08 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  24.44 
 
 		 112 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2189  anti-sigma-factor antagonist  26.14 
 
 		 111 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 115 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  27.36 
 
 		 250 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  22.45 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.85 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  24.39 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 113 aa  40.8  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 113 aa  40.8  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  23.47 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  25.51 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  24.39 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1556  sulphate transporter  27.27 
 
 		 568 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.902777  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  29.69 
 
 		 100 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1819  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 		 111 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>