19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0196 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0196  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 115 aa  236  5.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2094  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000638227  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3441  anti-sigma-factor antagonist  30.49 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1992  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3452  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.87 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.466044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1038  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.73 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0152  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1541  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  26.83 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3069  hypothetical protein  26.17 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401391 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1963  STAS domain protein  30.23 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.259711  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2416  anti-sigma-factor antagonist  28.41 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015086 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2957  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2820  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1503  anti-sigma-factor antagonist  30.11 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.696241  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4364  anti-sigma-factor antagonist  30.11 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  30.11 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3689  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2180  flagellar basal-body rod protein FlgB  25.56 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  28.74 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>