32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1771 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1771  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 		 102 aa  202  9e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1274  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 		 203 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.444037  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1992  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  35.06 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  31.03 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  31.03 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  31 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1681  anti-anti-sigma factor family protein  37.04 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34370  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  32.18 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2820  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  20.88 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1556  sulphate transporter  35.71 
 
 		 568 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.902777  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  32.76 
 
 		 134 aa  42.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  26.44 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0616  sulphate transporter  34.25 
 
 		 580 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1503  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 101 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.696241  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4364  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 101 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2843  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000855311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  31.33 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1963  STAS domain protein  32.18 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.259711  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1645  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.76 
 
 		 731 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.6 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  23.6 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  22.47 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>