26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1645 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1645  putative CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 
731 aa  1423    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0237  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
669 aa  158  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0874018 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0990  CheA signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 
1085 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1700  CheA signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
596 aa  68.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.284072  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 
1063 aa  61.2  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
730 aa  60.8  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  21.13 
 
 
1104 aa  53.5  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0632  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 
105 aa  50.8  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  27.12 
 
 
803 aa  50.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  28 
 
 
770 aa  50.4  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 
954 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  28 
 
 
770 aa  48.9  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  28.16 
 
 
785 aa  48.9  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  27.45 
 
 
769 aa  48.5  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  27 
 
 
769 aa  47.8  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2621  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  45.59 
 
 
120 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  26 
 
 
769 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  25.96 
 
 
783 aa  45.4  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2941  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  32.1 
 
 
116 aa  45.8  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1809  putative CheA signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
249 aa  45.8  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  28.3 
 
 
753 aa  44.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  28.28 
 
 
774 aa  44.3  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  28.3 
 
 
748 aa  44.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.1 
 
 
754 aa  44.3  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  27.36 
 
 
767 aa  44.3  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1281  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
116 aa  44.3  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>