63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1700 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1700  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
596 aa  1192    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.284072  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0237  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
669 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0874018 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1645  putative CheA signal transduction histidine kinases  29.5 
 
 
731 aa  128  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0990  CheA signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
1085 aa  89  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
1063 aa  82  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  23.68 
 
 
1104 aa  56.6  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  34.78 
 
 
758 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2112  CheA signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
565 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0156  chemotaxis protein CheA  33.04 
 
 
747 aa  53.9  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.93752  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  40.85 
 
 
784 aa  53.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 
728 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 
724 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 
724 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
713 aa  50.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  25.81 
 
 
733 aa  50.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
684 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  30.51 
 
 
685 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.54 
 
 
691 aa  49.7  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  39.73 
 
 
726 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  27.27 
 
 
702 aa  48.9  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2347  putative CheA signal transduction histidine kinases  27.68 
 
 
309 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 
920 aa  48.5  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2736  CheA signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 
687 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
919 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00412  probable two-component sensor (CheA)  27.97 
 
 
674 aa  48.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0721  CheA signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
544 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159017  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
1031 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 
957 aa  47.8  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
684 aa  47.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
760 aa  47.4  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
919 aa  47.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  24.77 
 
 
700 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 
685 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
770 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
650 aa  46.6  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
724 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
724 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
747 aa  47  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1989  ATP-binding region ATPase domain protein  29.41 
 
 
678 aa  47  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4461  CheA signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
662 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 
685 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
707 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
750 aa  46.2  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  27.2 
 
 
720 aa  46.2  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3196  CheA signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
542 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
671 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
759 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
1065 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3091  CheA signal transduction histidine kinases  31.96 
 
 
538 aa  45.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.832082  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  38.36 
 
 
1089 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
652 aa  45.1  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  32.84 
 
 
766 aa  45.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 
954 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 
766 aa  44.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  34.18 
 
 
729 aa  44.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
758 aa  44.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
1155 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  26.4 
 
 
741 aa  44.3  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2888  CheA signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
671 aa  43.9  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0298  CheA signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
763 aa  43.9  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265941  normal  0.326442 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
1030 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
732 aa  43.5  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
725 aa  43.5  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>