56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1274 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1274  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 203 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.444037  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1681  anti-anti-sigma factor family protein  57.29 
 
 		 105 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1032  anti-sigma-factor antagonist  45.19 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.94005  normal  0.950066 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 102 aa  63.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3698  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  50 
 
 		 121 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.938412  normal  0.756425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  39 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.25 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  40 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  31.33 
 
 		 138 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 117 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  35.92 
 
 		 126 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.12 
 
 		 113 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  32.56 
 
 		 109 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  32.1 
 
 		 121 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  37.11 
 
 		 122 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1771  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  36.26 
 
 		 102 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  27.78 
 
 		 113 aa  48.5  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 113 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  21.65 
 
 		 101 aa  47.4  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  36.05 
 
 		 113 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 		 115 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  35.87 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  21.18 
 
 		 111 aa  46.6  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 		 112 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.09 
 
 		 113 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1833  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190491  normal  0.904547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0208  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 103 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  24.71 
 
 		 105 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  41.79 
 
 		 121 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  33.72 
 
 		 110 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  36.49 
 
 		 111 aa  45.1  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 		 111 aa  45.1  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 		 103 aa  45.1  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  20.41 
 
 		 111 aa  45.1  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  31.52 
 
 		 117 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  27.59 
 
 		 112 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 111 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1048  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  37.5 
 
 		 137 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0475989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 113 aa  44.3  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  34.44 
 
 		 112 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  31.91 
 
 		 116 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  34.15 
 
 		 116 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 117 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  25.56 
 
 		 115 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 170 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2907  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.26 
 
 		 111 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  36.14 
 
 		 112 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 132 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  38.1 
 
 		 114 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 120 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 121 aa  41.6  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 		 116 aa  41.6  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  30.86 
 
 		 113 aa  41.2  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 		 113 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 		 113 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>