22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3698 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3698  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  100 
 
 		 121 aa  229  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.938412  normal  0.756425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1032  anti-sigma-factor antagonist  61.82 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.94005  normal  0.950066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1274  anti-sigma-factor antagonist  50 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.444037  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1681  anti-anti-sigma factor family protein  46.67 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  22.97 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  39 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  39 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.01 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  36.56 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  38.55 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  39.34 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  36.9 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  36.14 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  24.1 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  37.35 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2116  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  21.69 
 
 		 105 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 		 113 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  37.35 
 
 		 113 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>