29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1032 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1032  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 142 aa  263  7e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.94005  normal  0.950066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3698  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  61.82 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.938412  normal  0.756425 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1274  anti-sigma-factor antagonist  45.63 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.444037  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1681  anti-anti-sigma factor family protein  42.71 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  22.99 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  36.96 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.85 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  30.11 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.87 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  43.9  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  20.43 
 
 		 105 aa  43.5  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  32.38 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 116 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0208  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 103 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  24.72 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  33.75 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  33.73 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  21.65 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  20.62 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  27.42 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1048  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  34.78 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0475989 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2907  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.16 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>