209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0067 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  100 
 
 
123 aa  246  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  50.82 
 
 
123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  36.96 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  37.17 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.48 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  31.93 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  31.19 
 
 
249 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
104 aa  62.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 
110 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 
120 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 
113 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3493  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.892416  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  35.25 
 
 
118 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  35.42 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  28.83 
 
 
183 aa  60.8  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  34.86 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 
123 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  30.97 
 
 
117 aa  60.5  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  30.91 
 
 
117 aa  60.1  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  34.19 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  35.56 
 
 
112 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  30.11 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  31.36 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  33.94 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  32.69 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  29.63 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  33.33 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 
118 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  32.2 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  30.69 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  31.82 
 
 
99 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4483  anti-anti-sigma regulatory factor  35.79 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000247107  normal  0.911013 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  32.94 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  32.08 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  27.88 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 
250 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 
111 aa  54.7  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  30.68 
 
 
112 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2644  anti-sigma-factor antagonist  34.26 
 
 
107 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  32.29 
 
 
117 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 
115 aa  53.9  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  30.51 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  30.51 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  30.51 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  30.51 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  30.51 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  30.51 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  30.51 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3235  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.65 
 
 
437 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  26.42 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  28.07 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  25.49 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  36.26 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.59 
 
 
112 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  29.76 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  26.67 
 
 
111 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  26.67 
 
 
111 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 
116 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
250 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  25 
 
 
110 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1534  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.02614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  29.66 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  29.66 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  25.64 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  27.27 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0294  anti-sigma factor antagonist  27.78 
 
 
123 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  34.44 
 
 
111 aa  50.4  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 
115 aa  50.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  29.41 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  30.11 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.39 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  31.87 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  25.49 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  25.24 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  26.17 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  24.53 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  29.57 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>