201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0720 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  100 
 
 		 110 aa  225  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  48.18 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  35.51 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  40.21 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  33.65 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  31.19 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  32.04 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.67 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  35.78 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3235  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.96 
 
 		 437 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.65 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.65 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  36.9 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 250 aa  67  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  36.9 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.84 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  34.21 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  26.13 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  28.97 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  28.18 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  31.9 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  26.53 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 250 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  24.77 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  29 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  34.41 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  26.42 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  28.04 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  27 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1451  hypothetical protein  34.74 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2418  anti-sigma-factor antagonist  27.72 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.217831  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  26.73 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  24.77 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.61 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  31.4 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2860  anti-anti-sigma factor  30.93 
 
 		 429 aa  57  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  36.05 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.87 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  27 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  29.2 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  32.94 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  26.61 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2860  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  29.29 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  29.29 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  26.21 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  28.85 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0998  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  25.74 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  25.86 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  30.56 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  27.27 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1506  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 405 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  27.45 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  23.91 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0177  anti-sigma-factor antagonist  37.1 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.57 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  23.08 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  24.3 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  25 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3296  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  25.61 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1237  anti-sigma-factor antagonist  38.71 
 
 		 112 aa  50.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521699 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  26.85 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0427  anti-anti-sigma factor  29.09 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365585  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  25.64 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  24.32 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  25.25 
 
 		 436 aa  50.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>