More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2161 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
250 aa  512  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  85.94 
 
 
269 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  54.25 
 
 
249 aa  271  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  49.38 
 
 
250 aa  229  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0063  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  34.81 
 
 
140 aa  90.9  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0713993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2331  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.04 
 
 
151 aa  90.1  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  34.59 
 
 
570 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1160  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 
138 aa  86.3  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.620968  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2469  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1040  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  35.07 
 
 
143 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.469899  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5013  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.03 
 
 
141 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1666  sensor histidine kinase  36.07 
 
 
142 aa  80.5  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4032  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 
155 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0863  putative anti-sigma regulatory factor  34.33 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.286315 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.59 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2452  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.88 
 
 
147 aa  77  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0933  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.91 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0815302  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1313  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.4 
 
 
139 aa  74.7  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0887571  normal  0.148865 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2982  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
138 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3500  anti-sigma regulatory factor  31.4 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314034  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0750  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 
141 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.194451  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1452  hypothetical protein  35.07 
 
 
777 aa  73.2  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  29.32 
 
 
563 aa  72.4  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  33.33 
 
 
160 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  32.87 
 
 
160 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.13 
 
 
792 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  33.33 
 
 
160 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  32.87 
 
 
160 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  32.87 
 
 
160 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  32.87 
 
 
160 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  32.87 
 
 
160 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  38.14 
 
 
111 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  32.17 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2857  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.7 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  32.62 
 
 
160 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  32.62 
 
 
160 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1924  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 
492 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2441  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2317  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.128595  normal  0.13523 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1794  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.75 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1087  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
141 aa  65.1  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.07 
 
 
122 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.71 
 
 
137 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.122382  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 
110 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 
111 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  39.77 
 
 
108 aa  63.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  36.56 
 
 
109 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2418  anti-sigma-factor antagonist  38.95 
 
 
111 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.217831  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 
108 aa  63.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0700  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.53 
 
 
136 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 
141 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  34.02 
 
 
111 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  32.38 
 
 
116 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 
116 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 
116 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  38.04 
 
 
111 aa  62  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1796  hypothetical protein  36.28 
 
 
782 aa  62  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  33.68 
 
 
118 aa  62  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  40 
 
 
117 aa  62  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03913  hypothetical protein  28.69 
 
 
143 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 
113 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2113  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
137 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1228  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  31.11 
 
 
144 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.011235 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  29.85 
 
 
885 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  37.07 
 
 
122 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 
127 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  28.87 
 
 
159 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  28.87 
 
 
159 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.39 
 
 
110 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  28.87 
 
 
159 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 
117 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0837  RsbW protein, putative  31.39 
 
 
152 aa  60.1  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  35.79 
 
 
111 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 
121 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1522  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 
147 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  36.67 
 
 
111 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.63 
 
 
112 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.63 
 
 
112 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 
143 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2527  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.62 
 
 
147 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  38.96 
 
 
170 aa  59.7  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 
113 aa  59.7  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 
142 aa  59.3  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 
142 aa  59.3  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  35.87 
 
 
113 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1997  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 
495 aa  58.9  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 
113 aa  58.9  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.14 
 
 
110 aa  58.5  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.73 
 
 
129 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 
110 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2860  anti-sigma-factor antagonist  37.63 
 
 
113 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  36.19 
 
 
112 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  33.71 
 
 
115 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2188  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.71 
 
 
142 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  34.52 
 
 
100 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
147 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3706  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 
133 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0345536  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1493  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 
132 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>