86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0700 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0700  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 136 aa  278  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.122382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1794  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.37 
 
 		 134 aa  90.5  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4032  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.54 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0933  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0815302  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.89 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2469  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1666  sensor histidine kinase  34.43 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1160  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.620968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5013  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1990  sensor histidine kinase  33.07 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415496  normal  0.485112 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2527  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0863  putative anti-sigma regulatory factor  32 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.286315 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1040  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  30.16 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.469899  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  31.3 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0837  RsbW protein, putative  30.15 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0750  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.194451  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  31.4 
 
 		 885 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  32.17 
 
 		 570 aa  63.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1452  hypothetical protein  32.31 
 
 		 777 aa  63.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.65 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0887571  normal  0.148865 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.459983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  26.81 
 
 		 563 aa  61.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0063  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  30.71 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0713993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2331  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  29.1 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3443  putative anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  32.54 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0106512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2452  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0974  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0103078  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3500  anti-sigma regulatory factor  24.32 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2857  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2936  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03913  hypothetical protein  24.06 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1685  anti-sigma B factor  27.21 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2982  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1313  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  22.73 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1228  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  27.07 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.011235 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1022  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.43 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.126342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2102  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1232  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.53 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.240625  normal  0.172209 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1584  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3290  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.018648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2650  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1493  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.3 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2977  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase  27.13 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1014  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.06 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1522  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.59 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2661  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.07 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0789133  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1176  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.19 
 
 		 523 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0131066  normal  0.294907 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.37 
 
 		 792 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1426  rsbW protein, putative  26.87 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  37.29 
 
 		 313 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4100  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39959  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2441  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.43 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1997  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  23.28 
 
 		 495 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2353  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 428 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.657028  normal  0.419056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4818  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1924  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.97 
 
 		 492 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 298 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.37 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1094  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.63 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000660088  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  25.81 
 
 		 494 aa  43.5  0.0009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0590  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.72 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26678  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2790  histidine kinase  33.75 
 
 		 499 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12989  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  36.23 
 
 		 474 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03680  nitrogen regulation protein ntrY  28.24 
 
 		 470 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.177814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 732 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 495 aa  42.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2043  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.76 
 
 		 141 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000388253  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0614  anti-sigma F factor  25.23 
 
 		 148 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0196  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24 
 
 		 136 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  35.59 
 
 		 298 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0194  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.74 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3399  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 467 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392357  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 1070 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308131  normal  0.537019 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1087  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  22.58 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2056  anti-sigma regulatory factor  26.67 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.773482  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  24.39 
 
 		 475 aa  40.4  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3034  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.83 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000275353 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 1168 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4359  ATPase domain-containing protein  28.75 
 
 		 494 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>