73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0863 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0863  putative anti-sigma regulatory factor  100 
 
 		 143 aa  285  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.286315 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1040  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  98.6 
 
 		 143 aa  284  2.9999999999999996e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.469899  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0750  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  50.36 
 
 		 141 aa  150  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.194451  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  47.29 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.47 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0887571  normal  0.148865 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2469  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.21 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0933  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.43 
 
 		 142 aa  86.7  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0815302  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  31.11 
 
 		 570 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1160  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.11 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.620968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  34.33 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0063  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  30.71 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0713993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  32.82 
 
 		 249 aa  77.8  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  32.09 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2527  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2857  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1452  hypothetical protein  30.71 
 
 		 777 aa  75.5  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4032  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  29.55 
 
 		 563 aa  73.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1794  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.78 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2441  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2982  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0837  RsbW protein, putative  34.13 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0700  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.122382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5013  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2936  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.77 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1022  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.98 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.126342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  30.33 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1493  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.459983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1228  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  34.29 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.011235 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1666  sensor histidine kinase  28 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  28.68 
 
 		 885 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1685  anti-sigma B factor  29.79 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1924  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.81 
 
 		 492 aa  57.4  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1426  rsbW protein, putative  32.86 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03913  hypothetical protein  29.03 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2331  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3500  anti-sigma regulatory factor  25.21 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.48 
 
 		 792 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3443  putative anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  23.94 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0106512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2043  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.04 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000388253  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2285  anti-sigma F factor  28.87 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  27.36 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.68 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1014  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.48 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121242  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2102  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.31 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1584  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2650  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0072  serine-protein kinase  27.27 
 
 		 169 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642578 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2661  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.43 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0789133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  25.47 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  25.47 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.53 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  25.47 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 362 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 362 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2113  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.26 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  25.47 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  25.47 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1990  sensor histidine kinase  25.6 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415496  normal  0.485112 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  25.47 
 
 		 160 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  25.47 
 
 		 160 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2977  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase  27.05 
 
 		 141 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  25.47 
 
 		 160 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  25.47 
 
 		 160 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2905  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.94653  normal  0.27326 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2056  anti-sigma regulatory factor  32.56 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.773482  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1500  anti-sigma regulatory kinase  24.24 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  27 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0150  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.06 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.460194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4563  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 286 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>