75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03913 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03913  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  283  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2331  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.64 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1794  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1160  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.46 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.620968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0887571  normal  0.148865 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0933  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0815302  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.75 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  29.84 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2469  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.85 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1666  sensor histidine kinase  30.43 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5013  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  33.85 
 
 		 570 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  28.69 
 
 		 250 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  34.02 
 
 		 563 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1452  hypothetical protein  29.37 
 
 		 777 aa  59.3  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0750  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.91 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.194451  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  29.66 
 
 		 250 aa  57.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0837  RsbW protein, putative  31.93 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1040  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  28.12 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.469899  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0863  putative anti-sigma regulatory factor  29.03 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.286315 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2982  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.23 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1685  anti-sigma B factor  29.47 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0700  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.06 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4032  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.85 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2553  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 324 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2441  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.94 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0218  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  32.31 
 
 		 331 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.614577  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07231  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  33.33 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.152597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3034  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.45 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000275353 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2650  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1014  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.63 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121242  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1232  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.43 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.240625  normal  0.172209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3724  ATPase domain-containing protein  33.9 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1584  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0810  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.8 
 
 		 317 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2977  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase  25.93 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1426  rsbW protein, putative  26.85 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0063  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  27.78 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0713993 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1990  sensor histidine kinase  30.84 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415496  normal  0.485112 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1493  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.05 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3500  anti-sigma regulatory factor  29.21 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.122382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6671  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 		 357 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.314942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4105  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.17 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0408449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1228  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  27.08 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.011235 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1875  anti-sigma regulatory factor  28.24 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4100  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39959  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1118  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.227108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2838  putative anti-sigma regulatory factor serine/threonine protein kinase  34.07 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2857  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2661  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.73 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0789133  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2188  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1749  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.52 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2113  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.33 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0193  hypothetical protein  25.19 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  23.14 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2284  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.96 
 
 		 323 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0993778  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2515  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.17 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538602  normal  0.204677 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.05 
 
 		 147 aa  42.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12220  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  37.93 
 
 		 310 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2317  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.14 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.128595  normal  0.13523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3290  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.8 
 
 		 160 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.018648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3443  putative anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  28.23 
 
 		 147 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0106512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1701  putative anti-sigma regulatory factor serine/threonine protein kinase  25.6 
 
 		 140 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2468  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 147 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0214018  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1270  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  34.34 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  28.83 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1139  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.212464 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2936  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0072  serine-protein kinase  27.43 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4099  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.41 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256347  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  30.43 
 
 		 885 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>