69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3724 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3724  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 163 aa  328  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4105  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  77.03 
 
 		 151 aa  232  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0408449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0810  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.32 
 
 		 317 aa  97.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6671  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.17 
 
 		 357 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.314942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2284  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  46.49 
 
 		 323 aa  85.5  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0993778  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0218  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  39.86 
 
 		 331 aa  85.5  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.614577  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7185  putative signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 323 aa  75.1  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0066  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.44 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12220  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  37.3 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5207  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.441203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2553  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.81 
 
 		 324 aa  67.8  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3107  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.45 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3862  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 		 316 aa  61.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8734  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1514  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.91 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0502369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.46 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.477606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0117  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 331 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4100  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39959  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0030  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 		 144 aa  51.2  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 		 154 aa  50.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3290  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.018648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.903724  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  31.58 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03913  hypothetical protein  33.9 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4212  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0731  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.36 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.993652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  42.68 
 
 		 1045 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.3 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3034  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000275353 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4678  histidine kinase  29.57 
 
 		 340 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 368 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1160  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.18 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.620968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2974  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.71 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4990  sensor histidine kinase  30.09 
 
 		 340 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4563  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 		 286 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0271  sensor histidine kinase  30.09 
 
 		 340 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4962  sensor histidine kinase  30.09 
 
 		 340 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4588  sensor histidine kinase  30.36 
 
 		 340 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.868097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  26.14 
 
 		 885 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4949  sensor histidine kinase  30.36 
 
 		 340 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4726  sensor histidine kinase  30.36 
 
 		 340 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4568  sensor histidine kinase  30.36 
 
 		 340 aa  44.7  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00420124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5088  sensor histidine kinase  30.36 
 
 		 340 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0803  histidine kinase  29.8 
 
 		 718 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571523  hitchhiker  0.00843936 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1497  anti-sigma F factor  34.62 
 
 		 148 aa  44.7  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1794  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.8 
 
 		 134 aa  44.3  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.2 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2432  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 312 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0642435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.11 
 
 		 616 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  25.78 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1303  hypothetical protein  34.11 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0850702  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4977  sensor histidine kinase  30.36 
 
 		 340 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1390  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 		 468 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.057266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  31.96 
 
 		 309 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  32.43 
 
 		 1225 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0177  hypothetical protein  25 
 
 		 147 aa  42  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.160815  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3034  histidine kinase  45 
 
 		 434 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.154589 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3187  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.26 
 
 		 140 aa  42  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00310168  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8468  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 		 245 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2189  hypothetical protein  34.78 
 
 		 323 aa  41.2  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0960654  hitchhiker  0.00117014 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2115  Stage II sporulation E family protein  30 
 
 		 335 aa  41.2  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.614697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3102  hypothetical protein  30.3 
 
 		 345 aa  41.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.142812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1394  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 447 aa  40.8  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0477  anti-sigma F factor  33.64 
 
 		 157 aa  40.8  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.899963  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 414 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 489 aa  40.8  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0628  signal transduction protein  28.87 
 
 		 307 aa  40.4  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>