40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0348 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1990  sensor histidine kinase  36.73 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415496  normal  0.485112 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4032  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.62 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1794  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1493  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.06 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1666  sensor histidine kinase  28.15 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3443  putative anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  33.65 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0106512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1701  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  23.88 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.636544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1701  putative anti-sigma regulatory factor serine/threonine protein kinase  29.6 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2661  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0789133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2527  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.08 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  29.17 
 
 		 885 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2944  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  23.88 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.5 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.122382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0700  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.37 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1022  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.126342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5013  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0887571  normal  0.148865 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  36.56 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0837  RsbW protein, putative  28.06 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1426  rsbW protein, putative  26.13 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1431  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2469  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1875  anti-sigma regulatory factor  29.41 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03913  hypothetical protein  35.05 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1685  anti-sigma B factor  28.87 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5936  histidine kinase  33.33 
 
 		 373 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.67 
 
 		 792 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2113  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.66 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2977  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase  42.31 
 
 		 141 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  32.93 
 
 		 269 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 358 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1232  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.61 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.240625  normal  0.172209 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 735 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2650  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.18 
 
 		 141 aa  40.8  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1584  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.18 
 
 		 141 aa  40.8  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2043  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.4 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000388253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1228  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  24.32 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.011235 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 438 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>