199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6798 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  100 
 
 
150 aa  296  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  47.27 
 
 
114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7623  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  39.67 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3088  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  50 
 
 
126 aa  97.1  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  41.82 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  43.14 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  37.89 
 
 
102 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  38.68 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
110 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  37.17 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  38.14 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  36.19 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  39.39 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  35.59 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2076  anti-anti-sigma factor family protein  37.25 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  39.13 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  37.62 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  42.71 
 
 
111 aa  60.1  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  40 
 
 
112 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  35.64 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 
120 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  34.26 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  35.58 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3493  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.892416  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2907  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  40 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2644  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  30 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  38.14 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  34.04 
 
 
351 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  36.61 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  35.64 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  34.26 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 
112 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  31.13 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  36.84 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  31.82 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 
104 aa  54.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  22.64 
 
 
120 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 
111 aa  53.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  35.92 
 
 
132 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  38.61 
 
 
138 aa  53.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  32.04 
 
 
111 aa  53.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  24.55 
 
 
116 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  33.72 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7890  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.737942  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  40.58 
 
 
117 aa  52.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  27.45 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  25.45 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  36.96 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  27.45 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  39 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  34.78 
 
 
151 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  37.65 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.36 
 
 
112 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28 
 
 
129 aa  50.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5807  anti-sigma-factor antagonist  32.41 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.78678  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  32.67 
 
 
117 aa  50.1  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
113 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
113 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
113 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2630  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 
107 aa  50.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.692225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.8 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  24.77 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5185  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5274  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  32.29 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  22.94 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  22.94 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  22.94 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  22.94 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  22.94 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  22.94 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  29.09 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1592  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  29.63 
 
 
332 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.928127  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 
109 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1029  anti-sigma-factor antagonist  37.8 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  22.94 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1569  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  29.63 
 
 
332 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  34.67 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  22.94 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  22.94 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  22.94 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  29.36 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 
112 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 
103 aa  47.4  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>