140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2070 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  100 
 
 		 133 aa  266  8.999999999999999e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  65.49 
 
 		 117 aa  156  7e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3890  anti-sigma-factor antagonist  35.78 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0608567  decreased coverage  0.00481094 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  36 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.08 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  35.58 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.27 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1279  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.62 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0179706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  38.38 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  34.91 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1765  anti-sigma-factor antagonist  38.38 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  35.19 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0663  anti-sigma-factor antagonist  36.96 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0683  anti-sigma-factor antagonist  36.96 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  35.14 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  35.64 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  36.17 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0388  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  33.02 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  34.02 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  39.51 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  26.67 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.58 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  35.4 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1592  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  44.26 
 
 		 332 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.928127  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1569  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  44.26 
 
 		 332 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  34 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  38.57 
 
 		 351 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  40.58 
 
 		 114 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2518  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  45.71 
 
 		 350 aa  52  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  43.48 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  32.35 
 
 		 113 aa  52  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  35.24 
 
 		 113 aa  52  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  45.16 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  35.56 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  28.97 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  43.08 
 
 		 113 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.14 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  35.8 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2907  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.08 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  35.64 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2186  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 110 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  37.08 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  39.06 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2743  anti-sigma-factor antagonist  45.61 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0153  anti-anti-sigma factor  34.78 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  32.43 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  44.26 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7543  hypothetical protein  30.23 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  24.75 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  25.71 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2078  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  38.33 
 
 		 332 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000182563 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1255  anti-sigma-factor antagonist  36.62 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681714  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0182  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.29 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1523  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  42.86 
 
 		 336 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.229071  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  35.05 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  33.72 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  35.56 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  37.7 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  31.46 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3997  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  36.07 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  37.33 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  26.14 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  40.68 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  29.52 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  36.76 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  36.76 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  36.49 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>