91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1255 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1255  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 117 aa  236  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681714  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  37.72 
 
 		 114 aa  87  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  34.21 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1719  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.56 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.131448  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  26.42 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  26.6 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  32.76 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  30.67 
 
 		 112 aa  48.1  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  25.56 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  22.92 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  24.47 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  23.4 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1702  anti-anti-sigma regulatory factor  34.29 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.39095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  28.04 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0369  anti-sigma-factor antagonist  20.37 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.62 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  38.36 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3127  anti-sigma-factor antagonist  40.28 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4774  anti-sigma-factor antagonist  27.72 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558891  hitchhiker  0.00959736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  38.24 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3997  anti-sigma-factor antagonist  38.57 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  30.51 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  24.53 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  32.71 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  23.23 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1245  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  34.18 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 121 aa  43.5  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  29.33 
 
 		 121 aa  43.5  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  29.13 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2572  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  38.6 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.149516 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0915  anti-sigma-factor antagonist  26.88 
 
 		 243 aa  43.5  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4848  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  26.73 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  20.19 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2769  anti-sigma-factor antagonist  35.14 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.000540965 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  22.86 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.36 
 
 		 113 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.21 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0867  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.157195  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  23.08 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  30.48 
 
 		 118 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5095  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0632  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  28.92 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  39.13 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  29.29 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2424  anti-sigma-factor antagonist  39.13 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  24.76 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0391  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.04 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.250158  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0182  anti-sigma-factor antagonist  31.08 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7188  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  34.21 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09291  STAS domain-containing protein  30.12 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0243906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  26.6 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  24.76 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  24.76 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  24.76 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0260  anti-anti-sigma regulatory factor  30.12 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1279  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0179706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  24.76 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  29.52 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  24.76 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  24.76 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3797  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  24.76 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  24.75 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1978  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15781  STAS domain-containing protein  30.93 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  31.53 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4777  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00603517  hitchhiker  0.00801685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  32.05 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  28.38 
 
 		 104 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  28.38 
 
 		 104 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  30.99 
 
 		 111 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>