54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1245 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1245  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 110 aa  224  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0369  anti-sigma-factor antagonist  63.55 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  25.81 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  28.26 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  21.7 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1622  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  25.81 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  28.89 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  22.43 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  31.71 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  28.75 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  25.51 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  20.41 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  20.75 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3117  anti-anti-sigma regulatory factor  25 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3036  anti-sigma-factor antagonist  26.09 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000270393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  26.26 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  28.41 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  20.75 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.87 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1255  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681714  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7044  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  22.86 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  19.81 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  22.99 
 
 		 183 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  14 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  30.88 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  24.05 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  25.24 
 
 		 110 aa  42.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4098  anti-sigma-factor antagonist  23.47 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217078  normal  0.168859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3288  anti-sigma-factor antagonist  22.55 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0822137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  28.77 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  23 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  22.77 
 
 		 113 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  24.72 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  23.08 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  24.69 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  21.35 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1978  anti-sigma-factor antagonist  28.24 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0328  putative anti-sigma F factor antagonist  25.61 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  24.47 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  27.27 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  22.43 
 
 		 117 aa  41.2  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  19.78 
 
 		 105 aa  40.4  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  25.32 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  24.3 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  21.36 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  26.67 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  21.78 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>