94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1622 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1622  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
127 aa  256  9e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3036  anti-sigma-factor antagonist  71.79 
 
 
122 aa  179  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000270393 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4098  anti-sigma-factor antagonist  70.43 
 
 
120 aa  168  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217078  normal  0.168859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3288  anti-sigma-factor antagonist  69.64 
 
 
120 aa  164  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0822137  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  28.93 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  26.13 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0369  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0976  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 
237 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  23.85 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  25.23 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  26.61 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  24.35 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  25.47 
 
 
112 aa  53.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  24.78 
 
 
116 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  23.48 
 
 
116 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  28.57 
 
 
112 aa  51.6  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0732  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1245  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  23.28 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1223  anti-sigma-factor antagonist  28.74 
 
 
271 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068542 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  27 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  24.55 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  21 
 
 
112 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0710  response regulator receiver domain-containing protein  27.36 
 
 
240 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  22.73 
 
 
113 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  21.21 
 
 
112 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  21.74 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  26.79 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  23.42 
 
 
113 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  23.81 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  22.73 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  20 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  25 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  22.73 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  27.43 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  22.86 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  22.86 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  20 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  23.15 
 
 
250 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  27.03 
 
 
121 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  21.57 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  20 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2398  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.460172 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.47 
 
 
115 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  23.36 
 
 
112 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  23.42 
 
 
112 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  24.27 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  27.83 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  20.48 
 
 
102 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  24.21 
 
 
111 aa  43.9  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  21.43 
 
 
117 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  21.9 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  21.9 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  21.9 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  21.9 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  21.9 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  21.14 
 
 
183 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  21.9 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0410  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 
238 aa  42.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  21.9 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4213  anti-sigma-factor antagonist  35.59 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746918  normal  0.233717 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  20 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  20 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  20 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  26.67 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  22.68 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  26.39 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0029  anti-sigma-factor antagonist  36.21 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1978  anti-sigma-factor antagonist  26.72 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  20.95 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  23.75 
 
 
105 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  23.76 
 
 
110 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  21.78 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  19.42 
 
 
122 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  21.3 
 
 
109 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  15.65 
 
 
436 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  21.55 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  19.19 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  18.09 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  19.19 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  21.05 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  18.18 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  23.08 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  22.54 
 
 
142 aa  40.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  26.21 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  21.95 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  21.43 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03912  anti-sigma F factor antagonist  30.14 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  23.94 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  22.11 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>