98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03912 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03912  anti-sigma F factor antagonist  100 
 
 		 139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  37.37 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  35.06 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  38.36 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  27.43 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.62 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0701  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1506  anti-sigma-factor antagonist  37.08 
 
 		 405 aa  52.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.33 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  29.81 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 111 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  26.13 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  27.59 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  31.46 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  23.58 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  31.9 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  30.09 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.66 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  31.87 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  29.73 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  33.71 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  25.77 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.71 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  31.17 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  32.47 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  35.14 
 
 		 249 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  35.38 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  26.44 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  27.55 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2002  anti-sigma-factor antagonist  29.33 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  24.53 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  26.44 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  28.04 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  23.73 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 436 aa  43.5  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  33.77 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2409  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.6 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0998  anti-sigma-factor antagonist  27.72 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0391  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.43 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.250158  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  26.09 
 
 		 111 aa  42.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  26.88 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1622  anti-sigma-factor antagonist  27.03 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  26.6 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  27.56 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  25.88 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  30.11 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  27.72 
 
 		 269 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  27.72 
 
 		 250 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  32.1 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.53 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.05 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  26.09 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2860  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  26.09 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  25.88 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  25.49 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  25.47 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.05 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  33.71 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  30.77 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  30.77 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  32.91 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  26.88 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  26.88 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  26.88 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  26.88 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  26.88 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  26.88 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  26.88 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  26.88 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  26.88 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  25 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  24.72 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  24.47 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  25 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  25.56 
 
 		 116 aa  40  0.009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  25.53 
 
 		 112 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  26.14 
 
 		 109 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>