299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5547 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 123 aa  244  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  77.24 
 
 		 122 aa  186  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.78 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  36.7 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  36.04 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  37.84 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  41.28 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  37 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  40.22 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0333  anti-sigma factor antagonist  34.58 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  36.04 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  35.24 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  34.86 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  35.14 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  35.14 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  35.92 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  34.86 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  33.03 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  34.23 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  34.23 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  34.23 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  34.23 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  34.23 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  34.23 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  34.19 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  34.23 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  33.63 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  28.7 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  34.41 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  35.05 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  33.66 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  27.93 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  31.53 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  33.65 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  33.71 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0294  anti-sigma factor antagonist  31.62 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3448  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0429116  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.44 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  26.73 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  31.53 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  27.62 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  34.26 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  32.71 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.85 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.85 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  31.86 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  27.08 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  25.77 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  27.93 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.11 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  26.36 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  35.8 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  25.47 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  31.68 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  27.36 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  25.96 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  28.32 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  30.7 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  29.46 
 
 		 250 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  30.11 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  32.63 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  34.52 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  26.73 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>