123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1978 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1978  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 119 aa  235  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  44.25 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1765  anti-sigma-factor antagonist  44.25 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3997  anti-sigma-factor antagonist  38.95 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  33.63 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 119 aa  62  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2743  anti-sigma-factor antagonist  39.13 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  35.71 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  34.91 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  28.83 
 
 		 111 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  27.93 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  38.55 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  29.87 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  32.63 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  28.07 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  27.03 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  29.73 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  37.31 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  35.14 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  34.94 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  36.23 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  27.03 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  35.4 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  28.83 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  39.39 
 
 		 170 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.41 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1702  anti-anti-sigma regulatory factor  33.96 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.39095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  34.94 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  26.88 
 
 		 183 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1719  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  34.09 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.131448  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  34.95 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  26.13 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  31.94 
 
 		 249 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7890  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.737942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 112 aa  47.8  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0427  anti-anti-sigma factor  32.89 
 
 		 112 aa  47.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365585  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  27.43 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.64 
 
 		 113 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  25.64 
 
 		 109 aa  47.4  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  26.85 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3036  anti-sigma-factor antagonist  26.23 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000270393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  27.43 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  27.43 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  27.43 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  27.43 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  27.43 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  28.32 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  37.88 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  27.43 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  27.43 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  27.88 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  25.93 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  32.39 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  27.43 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  26.17 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  26.85 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  27.43 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  26.55 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  26.55 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  35.21 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  32.88 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0369  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.16 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.75 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  30.93 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  25.66 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  35.44 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  32.5 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  32.2 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  28.09 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  28.32 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  26.92 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4098  anti-sigma-factor antagonist  27.03 
 
 		 120 aa  43.9  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217078  normal  0.168859 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  27.52 
 
 		 122 aa  42.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3117  anti-anti-sigma regulatory factor  28.21 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4611  anti-sigma-factor antagonist  30.99 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3288  anti-sigma-factor antagonist  26.55 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0822137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  31.34 
 
 		 121 aa  42.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  24.79 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  21.15 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.51 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2198  anti-sigma-factor antagonist  25.77 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>