100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4098 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4098  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 120 aa  240  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217078  normal  0.168859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3288  anti-sigma-factor antagonist  92.5 
 
 		 120 aa  227  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0822137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3036  anti-sigma-factor antagonist  75.65 
 
 		 122 aa  179  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000270393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1622  anti-sigma-factor antagonist  70.43 
 
 		 127 aa  168  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0976  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  28.04 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  22.81 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  25.23 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  29.33 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  23.64 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  22.61 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0369  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  25.47 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  25.93 
 
 		 250 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  27.03 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  22.03 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0732  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  24.07 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  23.3 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  22.32 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  27.1 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  26.79 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  23.96 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0710  response regulator receiver domain-containing protein  24.27 
 
 		 240 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  22.22 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  22.22 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  24.76 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.03 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2409  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  19.44 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  21.3 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  21.3 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4213  anti-sigma-factor antagonist  31.75 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746918  normal  0.233717 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2398  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.460172 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  19.44 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  25.53 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  19.61 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  19.44 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3235  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  24.3 
 
 		 437 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  22.73 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.03 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  26.73 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  25.32 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0410  anti-sigma-factor antagonist  25.23 
 
 		 238 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0029  anti-sigma-factor antagonist  31.75 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.14 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  22.86 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  23.68 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  21.43 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  22.92 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  20.43 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1223  anti-sigma-factor antagonist  29.49 
 
 		 271 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  25.23 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  20 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  20 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  20 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  18.95 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  20.37 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  20.83 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  25.97 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  22.81 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  20.73 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  20.73 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1978  anti-sigma-factor antagonist  27.03 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06941  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  22.12 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00555121  normal  0.159245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  20.79 
 
 		 122 aa  43.5  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  18.52 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5017  anti-sigma-factor antagonist  20.95 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  24 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  25.93 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  20.56 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1245  anti-sigma-factor antagonist  23.47 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  22.81 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  23.88 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 114 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  26.03 
 
 		 111 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2303  anti-sigma-factor antagonist  25.45 
 
 		 114 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.923761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  24.3 
 
 		 116 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1390  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.27 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  20.83 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  20 
 
 		 436 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  22.22 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  23.33 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  26.76 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  23.33 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  23.33 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  23.33 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  23.33 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  23.33 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  23.33 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  23.33 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  23.33 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  22.43 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  24 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  19.27 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2860  anti-anti-sigma factor  23.86 
 
 		 429 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 		 111 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>