83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2303 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2303  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 114 aa  231  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.923761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  34.34 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  33.33 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  34.31 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 436 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  32.41 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 250 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  30.1 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0046  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  28.04 
 
 		 111 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 111 aa  50.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  29.63 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.11 
 
 		 134 aa  50.1  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2860  anti-anti-sigma factor  31.37 
 
 		 429 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  28.04 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  27.03 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3235  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.07 
 
 		 437 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2860  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  28.74 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  28.74 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  28.74 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2409  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  31.31 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  24.77 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  23.4 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  25.49 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  25.49 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2744  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.146938  normal  0.0434757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  21.7 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2758  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  32.1 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  27.08 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.39 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  27.93 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  24.07 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  26.47 
 
 		 114 aa  42.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  30.11 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.87 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3036  anti-sigma-factor antagonist  25.93 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000270393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  25.26 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  29 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  32.53 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  23.81 
 
 		 127 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 		 110 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 110 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  24.76 
 
 		 110 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4098  anti-sigma-factor antagonist  25.45 
 
 		 120 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217078  normal  0.168859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4094  anti-sigma-factor antagonist  24.11 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.47 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3288  anti-sigma-factor antagonist  24.55 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0822137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  34.09 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  23.85 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2418  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.217831  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  27.55 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  31.19 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  26.73 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  23.33 
 
 		 351 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1592  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  24.74 
 
 		 332 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.928127  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1569  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  24.74 
 
 		 332 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  25.47 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  25.71 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  26.92 
 
 		 118 aa  40  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>