47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4094 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4094  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 113 aa  228  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2418  anti-sigma-factor antagonist  54.64 
 
 		 111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.217831  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  28.18 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  36.96 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0701  anti-sigma-factor antagonist  29.29 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  29 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0046  anti-sigma-factor antagonist  27.03 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  36.89 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  37.65 
 
 		 269 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  23.15 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.21 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2002  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 115 aa  47.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 		 109 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.09 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  25.84 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  29.79 
 
 		 249 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 		 250 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  26.47 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  24.72 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.59 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.93 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  26.44 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4611  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  29.47 
 
 		 111 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.46 
 
 		 115 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  24.24 
 
 		 113 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.3 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2303  anti-sigma-factor antagonist  24.11 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.923761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  25.51 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>