148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0328 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0328  putative anti-sigma F factor antagonist  100 
 
 		 97 aa  199  9e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  59.79 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  44.33 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0820  anti-sigma-factor antagonist  41.25 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  38.3 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  38.3 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  37.23 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  36.96 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.23 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  31.96 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  34.41 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  32.63 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  34.41 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  36.84 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  32.93 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  33.68 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1080  anti-sigma-factor antagonist  32.99 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  30.11 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  36.26 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2189  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.47 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  28.41 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0958  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 198 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  34.09 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  34.09 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  31.11 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  30.49 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  35.63 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  35.63 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  32.58 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1592  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  35.96 
 
 		 332 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.928127  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1569  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  35.96 
 
 		 332 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1913  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  27.66 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.464554  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  31.87 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 116 aa  50.1  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  27.96 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  32.93 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  35.38 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  31.71 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  31.71 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  31.65 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  31.65 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  31.65 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  31.65 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1395  anti-anti-sigma factor, putative  32.29 
 
 		 256 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.392973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  31.65 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  28.92 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  35.82 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0591  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  31.65 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  31.65 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1183  anti-anti-sigma factor, putative  26.32 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.136533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.75 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2283  anti-sigma-factor antagonist  32.56 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  31.65 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  34.94 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1523  anti-sigma-factor antagonist  32.91 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  32.88 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  25.81 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  31.4 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  32.41 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 249 aa  46.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2186  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  32.05 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  33.87 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  32.84 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  34.09 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  33.72 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  28.09 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  30.34 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  27.91 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2078  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  33.33 
 
 		 332 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000182563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  24.74 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  33.82 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  25.56 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  33.75 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0312  hypothetical protein, putative anti-sigma factor antagonist  36.62 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.03 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>