26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1395 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1395  anti-anti-sigma factor, putative  100 
 
 		 256 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.392973  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1200  anti-sigma-factor antagonist  55.4 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0958  anti-sigma-factor antagonist  55.85 
 
 		 198 aa  197  9e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1183  anti-anti-sigma factor, putative  53.96 
 
 		 204 aa  189  5e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.136533 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1080  anti-sigma-factor antagonist  70.59 
 
 		 130 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1361  anti-sigma-factor antagonist  59.7 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00653579  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1117  anti-sigma-factor antagonist  59.29 
 
 		 190 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.180588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  40.32 
 
 		 112 aa  53.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 111 aa  49.3  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 110 aa  48.5  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  27.55 
 
 		 111 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 113 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0328  putative anti-sigma F factor antagonist  35.71 
 
 		 97 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 110 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  28.04 
 
 		 111 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 113 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  26.47 
 
 		 111 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  26.76 
 
 		 138 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  30.99 
 
 		 116 aa  44.7  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 109 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1913  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  29.58 
 
 		 127 aa  42.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.464554  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 		 117 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0591  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 		 120 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  32.31 
 
 		 127 aa  42.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  22.45 
 
 		 157 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  35.21 
 
 		 841 aa  42  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>