34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1117 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1117  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 190 aa  384  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.180588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1361  anti-sigma-factor antagonist  57.14 
 
 		 204 aa  200  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00653579  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1200  anti-sigma-factor antagonist  64.06 
 
 		 212 aa  167  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1183  anti-anti-sigma factor, putative  49.24 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.136533 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1080  anti-sigma-factor antagonist  66.39 
 
 		 130 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1395  anti-anti-sigma factor, putative  55.47 
 
 		 256 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.392973  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0958  anti-sigma-factor antagonist  61.9 
 
 		 198 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  26.47 
 
 		 111 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 111 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 110 aa  47.8  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 113 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2691  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  31.68 
 
 		 332 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.721322  normal  0.111915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 113 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1913  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  33.8 
 
 		 127 aa  46.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.464554  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 112 aa  46.2  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  23.33 
 
 		 157 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  29.33 
 
 		 116 aa  45.1  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2221  anti-sigma-factor antagonist  30.86 
 
 		 97 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1878  anti-sigma-factor antagonist  30.86 
 
 		 97 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838395  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2096  anti-sigma-factor antagonist  30.86 
 
 		 97 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  25.96 
 
 		 118 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  23.15 
 
 		 120 aa  43.9  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  25.53 
 
 		 111 aa  43.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  27.38 
 
 		 111 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  27.38 
 
 		 111 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  26.76 
 
 		 110 aa  42.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2107  SpoIIAA family protein  36.54 
 
 		 96 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  28.36 
 
 		 108 aa  42.4  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  21.57 
 
 		 113 aa  41.6  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0328  putative anti-sigma F factor antagonist  29.17 
 
 		 97 aa  42  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5017  anti-sigma-factor antagonist  26.79 
 
 		 119 aa  42  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  22.45 
 
 		 111 aa  41.6  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 119 aa  41.6  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  24.77 
 
 		 111 aa  41.6  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>