30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1200 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1200  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 212 aa  425  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0958  anti-sigma-factor antagonist  65.93 
 
 		 198 aa  232  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1395  anti-anti-sigma factor, putative  65.03 
 
 		 256 aa  221  4e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.392973  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1183  anti-anti-sigma factor, putative  56.6 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.136533 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1080  anti-sigma-factor antagonist  75.19 
 
 		 130 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1361  anti-sigma-factor antagonist  51.61 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00653579  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1117  anti-sigma-factor antagonist  69.91 
 
 		 190 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.180588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1078  hypothetical protein  37.27 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1913  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  32.39 
 
 		 127 aa  48.9  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.464554  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 113 aa  48.5  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  33.87 
 
 		 112 aa  47  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  28.83 
 
 		 110 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  34.52 
 
 		 104 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  34.52 
 
 		 104 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  26.21 
 
 		 111 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  25.24 
 
 		 111 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  26.61 
 
 		 113 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  23.71 
 
 		 117 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  26.09 
 
 		 110 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  19.39 
 
 		 157 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  24.77 
 
 		 111 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  32.89 
 
 		 109 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  27.91 
 
 		 111 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  27.91 
 
 		 111 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  26.74 
 
 		 116 aa  42.4  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  29.85 
 
 		 114 aa  42.4  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 115 aa  42  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 		 111 aa  41.6  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3296  anti-sigma-factor antagonist  31.17 
 
 		 92 aa  41.6  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  25 
 
 		 122 aa  41.2  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>