127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2186 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2186  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 110 aa  226  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  38.95 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  36.11 
 
 		 111 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  32.11 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  30.93 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  30.93 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  33.67 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  29.9 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  29.9 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  29.9 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  29.9 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  29.9 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  29.9 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  29.9 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.59 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.53 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  31.48 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  40.58 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  41.43 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0153  anti-anti-sigma factor  34.29 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  28.99 
 
 		 142 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  35.11 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  23.42 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  36.26 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  31.34 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 113 aa  50.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.21 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2283  anti-sigma-factor antagonist  42.03 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  30.91 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  32.05 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  28.83 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  25.44 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  25.77 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0177  anti-sigma-factor antagonist  41.51 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  31.43 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0328  putative anti-sigma F factor antagonist  32.97 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  26.04 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  36.23 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  32.97 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  27.93 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2424  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2189  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2409  anti-sigma-factor antagonist  24.49 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0752  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  32.39 
 
 		 318 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  34.15 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2311  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.85 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0655484 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  32.31 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  36.76 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  27.63 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  26.88 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  33.93 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  27.45 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  21.43 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0945  anti-anti-sigma regulatory factor  23.53 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959965  hitchhiker  0.00175597 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  29.09 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  26.09 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  29.21 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  24.77 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1390  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  18.07 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  27 
 
 		 250 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  28.81 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  21.43 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0820  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  31.07 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  27.94 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3296  anti-sigma-factor antagonist  31.17 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2198  anti-sigma-factor antagonist  36.84 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0301  anti-sigma-factor antagonist  25.96 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01716  putative anti-sigma factor antagonist  26.25 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0388  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  28.41 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  28.83 
 
 		 112 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  28.17 
 
 		 269 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 110 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>