72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4777 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4777  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 108 aa  218  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00603517  hitchhiker  0.00801685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4774  anti-sigma-factor antagonist  60.47 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558891  hitchhiker  0.00959736 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1390  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.34 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  40.35 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  36.51 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  37.93 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  40.32 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  31.43 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1681  anti-anti-sigma factor family protein  42.11 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  31.88 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1096  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.927146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  39.29 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  38.71 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  32.81 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  34.12 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0369  anti-sigma-factor antagonist  29.82 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  26.23 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  33.33 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  26.73 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  31.51 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0509  conserved hypothetical protein containing  31.58 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  35.19 
 
 		 111 aa  43.9  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  33.72 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3997  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  32.73 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  24.73 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  36.07 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5017  anti-sigma-factor antagonist  35.56 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  32.79 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  29.31 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.54 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0388  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  32.2 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  33.33 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  30.65 
 
 		 117 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  26.56 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  39.29 
 
 		 116 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2078  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  30.61 
 
 		 332 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000182563 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  26.56 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 113 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 		 121 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  28.07 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  26.98 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0945  anti-anti-sigma regulatory factor  24.47 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959965  hitchhiker  0.00175597 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  28.07 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  32.79 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  35.09 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  20.83 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  27.42 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.36 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  36.36 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  28.26 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.43 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  26.37 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  32.73 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7543  hypothetical protein  35.85 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1255  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681714  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  30.65 
 
 		 112 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>