47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2572 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2572  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 		 176 aa  352  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.149516 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2769  anti-sigma-factor antagonist  84.83 
 
 		 178 aa  296  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.000540965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  47.76 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  47.76 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  33.65 
 
 		 114 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  47.76 
 
 		 113 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1630  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 114 aa  52  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 110 aa  51.6  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5225  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0769527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  37.04 
 
 		 99 aa  48.9  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  40.85 
 
 		 151 aa  48.5  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  38.67 
 
 		 115 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  38.33 
 
 		 109 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4848  anti-sigma-factor antagonist  40.3 
 
 		 118 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0951523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  40.62 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2767  anti-sigma-factor antagonist  35.94 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314327  hitchhiker  0.000519176 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  36.78 
 
 		 112 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  41.54 
 
 		 117 aa  45.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3069  hypothetical protein  36.23 
 
 		 109 aa  45.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401391 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0046  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  45.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3997  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 113 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  32.61 
 
 		 122 aa  45.1  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  35.44 
 
 		 113 aa  44.7  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1702  anti-anti-sigma regulatory factor  31.25 
 
 		 113 aa  44.3  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.39095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  35.62 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  37.65 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  35.44 
 
 		 113 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  30.49 
 
 		 110 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 131 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1255  anti-sigma-factor antagonist  38.6 
 
 		 117 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681714  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2687  anti-sigma-factor antagonist  32.05 
 
 		 104 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  40.35 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  40.85 
 
 		 106 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 110 aa  42.4  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  39.34 
 
 		 109 aa  42  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.52 
 
 		 115 aa  41.6  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4150  anti-sigma-factor antagonist  42.65 
 
 		 122 aa  41.6  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  37.93 
 
 		 99 aa  41.6  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  43.86 
 
 		 118 aa  41.6  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  37.93 
 
 		 101 aa  41.6  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  28.09 
 
 		 112 aa  41.2  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  29.73 
 
 		 102 aa  41.2  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3946  anti-sigma-factor antagonist  39.39 
 
 		 112 aa  40.8  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 121 aa  40.8  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0701  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 		 116 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>