83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1819 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1819  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 111 aa  216  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27120  anti-anti-sigma factor  40.54 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  40.2 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  37.38 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  39.13 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  41.11 
 
 		 151 aa  52.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  37.89 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2608  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0996  anti-anti-sigma regulatory factor  39.29 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2644  anti-sigma-factor antagonist  40.7 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  32.04 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 		 249 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0203  anti-sigma-factor antagonist  32.38 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  32.99 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  39 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  28.71 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0391  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.58 
 
 		 109 aa  47.4  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.250158  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  35.05 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  27.47 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  33.98 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0702  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44246  normal  0.0163472 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0820  anti-sigma-factor antagonist  36.56 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2116  anti-sigma-factor antagonist  35.9 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0561047  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2862  anti-sigma-factor antagonist  38.1 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0828  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.48 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  35.79 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  25.81 
 
 		 132 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1153  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.43 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.14 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.58 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5274  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2306  anti-sigma-factor antagonist  35.4 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00064789  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3834  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0968  anti-sigma-factor antagonist  36.08 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.226616  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5185  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1306  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  26.73 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4150  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  27.96 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  23.86 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1282  anti-sigma-factor antagonist  34.25 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1311  anti-sigma-factor antagonist  34.25 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  36.19 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1299  anti-sigma-factor antagonist  34.25 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0217116  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4483  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 119 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  24.04 
 
 		 120 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  27.66 
 
 		 120 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26340  anti-anti-sigma factor  34.12 
 
 		 142 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 127 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  27 
 
 		 117 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 113 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2804  anti-sigma-factor antagonist  25.47 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  27.43 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6798  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  33.33 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3493  anti-sigma-factor antagonist  31.53 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.892416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4788  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0365587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4115  anti-sigma-factor antagonist  44.93 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0231593  normal  0.0203819 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  27 
 
 		 115 aa  40.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2021  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2283  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0348  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06941  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  22.89 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00555121  normal  0.159245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0369  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4483  anti-anti-sigma regulatory factor  31.11 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000247107  normal  0.911013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0359  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280316  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 250 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1992  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 		 107 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>